El chakra es en pocas palabras, la energía que utilizas al hacer una técnica. Básicamente para llevar a cabo un ninjutsu o un genjutsu, es necesario mezclar tu chakra (el cual no es más que la energía del cuerpo recogida por las células a lo largo del mismo y la del espíritu, que es conseguida gracias a la experiencia). Entonces mediante la correcta elaboración del sello la técnica puede ser activada. Una vez que el chakra ha sido activado, pueden realizarse varias técnicas y movimientos. Sin el chakra, un ninja no sería gran cosa.

 

   

Chakra curativo

Este es el chakra que un ninja médico como Tsunade o Shizune usarían para curar a alguien. Se manifiesta como una luz verde, y puede curar los daños físicos sufridos. Todo lo que sabemos acerca de este tipo de chakra es que puede sanar heridas a una gran velocidad, no sabemos si todos los ninjas tienen o pueden moldearlo. Parece ser que el que usa este tipo de chakra lo concentra en sus manos y luego toca la herida para llevar a cabo el proceso de curación. Desconocemos si este chakra puede usarse para otras habilidades.

Aquellos ninjas que poseen una gran cantidad de chakra (ej. Naruto) van a tener la habilidad de realizar técnicas sumamente poderosas, incluso en innumerables ocasiones en un mismo combate. Una gran cantidad de chakra también le otorga mayor resistencia al ninja, permitiéndole recibir mayor cantidad de ataques versus un ninja con menor cantidad de chakra. La cantidad de chakra puede ser incrementada mediante la práctica y el combate, pero aquellos ninjas con cantidades inmensas de chakra suelen ser casos excepcionales, como lo son Naruto y Gaara, quienes poseen cantidades de chakra inmensas pos ser jinchuriki o recipientes de demonios con colas, quienes les otorgan esa enorme cantidad de chakra. Existen también formas de aumentar el chakra temporeramente pero en gran medida, esto puede realizarse por ejemplo, mediante píldoras especiales como lo es la píldora de soldado, la cual duplica el chakra del individuo o las píldoras del Clan Akimichi, que pueden aumentar grandemente el chakra, pero que a su vez ponen en riesgo la vida de quien las usa. Existen también técnicas de alto nivel, que pueden incrementar el flujo de chakra de forma sorprendente, entre estas se encuentra la apertura de puertas celestiales, que pueden otorgar a un ninja que logra abrir la 8va puerta, puerta de la muerte, un nivel de pelea superior al de un Kage pero que por otro lado puede poner su vida en riesgo, llevandolo incluso a la muerte. El sello maldito de Orochimaru, es otra técnica que le permite a este otorgarle a un ninja, luego de haberlo mordido, un gran nivel de chakra, y posteriormente, pasando por un proceso adecuado, que lleva al ninja que posee este sello, a un estado de muerte, si este logra sobrevivir, es capaz de incrementar su chakra de forma descomunal en lo que se conoce como los dos niveles del sello maldito.
    

Existe un tercer factor que requiere un nivel avanzado de destreza por parte del ninja, que de ser dominado, coloca al ninja en una posición muy superior a la de otros ninjas que no saben dominar dicho factor, y es la capacidad de un ninja para utilizar la naturaleza de su chakra dominante. Como dijimos al principio, existen 5 tipos de chakra, que no son otra cosa que los 5 chakras naturales que le dieron nombre a los 5 grandes países ninja: fuego, viento, agua, tierra y relámpago, por lo que la mayoría de los ninjas tiene una inclinación hacia cierta naturaleza en particular. Aquellos ninjas que logren manipular correctamente su chakra dominante, pueden llegar a realizar jutsus más poderosos del tipo de chakra dominante que poseen.